MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	GAT	2	6	297470	297475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013205	CCT	2	6	297526	297531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013205	ATGG	2	8	297563	297570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013205	GT	3	6	297575	297580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013205	CT	3	6	297602	297607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_013205	GAA	2	6	297691	297696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013205	CAG	2	6	297788	297793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013205	AGT	2	6	297881	297886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013205	GCGA	2	8	297888	297895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_013205	GGA	2	6	297900	297905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013205	GCG	2	6	297968	297973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013205	AGCC	2	8	297985	297992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_013205	GGCC	2	8	298024	298031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_013205	CG	3	6	298060	298065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_013205	ACC	2	6	298130	298135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_013205	GCGA	2	8	298311	298318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_013205	GGA	2	6	298328	298333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013205	AAGCGA	2	12	298344	298355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1019	NC_013205	GCGA	2	8	298668	298675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_013205	AGC	2	6	298788	298793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013205	CAT	2	6	298794	298799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013205	TGG	2	6	298936	298941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013205	CCG	2	6	298999	299004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_013205	ACC	2	6	299108	299113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_013205	AGG	2	6	299141	299146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013205	AGC	2	6	299181	299186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013205	GGGA	2	8	299237	299244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013205	GC	3	6	299352	299357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_013205	GAAG	2	8	299425	299432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013205	AGG	2	6	299540	299545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013205	G	6	6	299551	299556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013205	CGG	2	6	299592	299597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013205	GA	3	6	299690	299695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013205	GTA	2	6	299708	299713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013205	ACC	2	6	299863	299868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_013205	GTT	2	6	299880	299885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013205	CCT	2	6	299951	299956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_013205	CG	3	6	300004	300009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_013205	GGT	2	6	300087	300092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013205	CGT	2	6	300282	300287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013205	ACCG	2	8	300366	300373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013205	GAAG	2	8	300488	300495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013205	GAC	2	6	300510	300515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013205	ACG	2	6	300607	300612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013205	GCGA	2	8	300645	300652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_013205	CGAG	2	8	300684	300691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_013205	GGGA	2	8	300786	300793	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013205	CCT	2	6	300796	300801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_013205	AGGT	2	8	300806	300813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013205	AGACG	2	10	300893	300902	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_013205	TTC	2	6	300962	300967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013205	CCG	2	6	300973	300978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013205	CCAG	2	8	300983	300990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013205	ACCT	2	8	301048	301055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_013205	CAG	2	6	301060	301065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013205	CAA	2	6	301196	301201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013205	ACG	2	6	301231	301236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_013205	GAGG	2	8	301267	301274	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013205	ACG	2	6	302535	302540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013205	CGA	2	6	302544	302549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013205	GAAA	2	8	302773	302780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013205	GTG	2	6	302860	302865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013205	GGC	2	6	302875	302880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013205	AGGG	2	8	302918	302925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013205	AGT	2	6	303090	303095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013205	AGG	2	6	303100	303105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013205	GAAG	2	8	305624	305631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013205	CCG	3	9	305804	305812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013205	GCGAGA	2	12	305817	305828	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_013205	AAT	2	6	305914	305919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013205	GCG	2	6	306017	306022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013205	GA	3	6	306093	306098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013205	GAG	2	6	306127	306132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013205	ACG	4	12	306283	306294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013205	TCC	2	6	306872	306877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_013205	GAT	2	6	306933	306938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013205	GAA	2	6	306958	306963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013205	TA	3	6	306969	306974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013205	AGA	2	6	306982	306987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013205	CCT	2	6	309309	309314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_013205	ACA	2	6	309330	309335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013205	GAA	2	6	309380	309385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013205	GTG	2	6	309403	309408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013205	ATG	2	6	309445	309450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013205	CGC	2	6	309475	309480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_013205	GGT	2	6	309487	309492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013205	GGT	2	6	315147	315152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013205	GAG	2	6	315170	315175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013205	CG	3	6	316724	316729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_013205	GCT	2	6	316775	316780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013205	TGC	2	6	316791	316796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013205	ACG	2	6	316965	316970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_013205	ACG	2	6	317058	317063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013205	CGATAT	2	12	317134	317145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1095	NC_013205	GAA	2	6	317222	317227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013205	T	6	6	317302	317307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013205	TTTG	2	8	317324	317331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013205	GTAT	2	8	317377	317384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013205	CGG	2	6	317413	317418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013205	CGTG	2	8	319279	319286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_013205	ACC	2	6	319380	319385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013205	CAG	2	6	319388	319393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013205	CGT	2	6	319498	319503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013205	GAA	2	6	319535	319540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013205	GGC	2	6	319558	319563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_013205	CATCGA	2	12	319579	319590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013205	GC	3	6	319673	319678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_013205	CGC	2	6	319738	319743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_013205	CCA	2	6	319780	319785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_013205	GCA	2	6	319838	319843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013205	GGC	2	6	319876	319881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_013205	GC	3	6	319919	319924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_013205	TG	4	8	319932	319939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013205	GCG	2	6	319999	320004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013205	CAT	2	6	320023	320028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013205	ACC	2	6	320037	320042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013205	CGA	2	6	320058	320063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_013205	ACG	2	6	320085	320090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013205	CGA	2	6	320118	320123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013205	GAC	2	6	320226	320231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013205	GT	3	6	320251	320256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013205	AC	3	6	320407	320412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_013205	CCCG	2	8	320475	320482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1124	NC_013205	GCA	2	6	321346	321351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013205	TCG	2	6	321364	321369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013205	GCG	2	6	321399	321404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013205	GC	3	6	321420	321425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_013205	CAGG	2	8	321429	321436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_013205	GCC	3	9	321462	321470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_013205	GC	4	8	321482	321489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013205	GACG	2	8	321507	321514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_013205	GTG	2	6	321640	321645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013205	GC	3	6	321687	321692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_013205	CGC	2	6	321710	321715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013205	CG	3	6	321749	321754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_013205	CG	3	6	321775	321780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_013205	TGA	2	6	321868	321873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1240	NC_013205	GTG	2	6	367297	367302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_013205	CTC	2	6	367351	367356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1243	NC_013205	CT	3	6	367411	367416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_013205	GCGA	2	8	367438	367445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1245	NC_013205	GCG	2	6	367472	367477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1250	NC_013205	GGT	2	6	370188	370193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_013205	CCG	2	6	372700	372705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_013205	CCT	2	6	374271	374276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_013205	TCGGAC	2	12	374419	374430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_013205	GAG	2	6	374514	374519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_013205	TGCATG	2	12	375991	376002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1257	NC_013205	CAC	2	6	376092	376097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_013205	CGC	2	6	376138	376143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1259	NC_013205	GC	3	6	376142	376147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1260	NC_013205	CGC	2	6	376194	376199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_013205	GAG	2	6	376233	376238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_013205	GAC	2	6	376240	376245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_013205	ATTC	2	8	379432	379439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_013205	TTC	2	6	379488	379493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_013205	CCG	2	6	379520	379525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1266	NC_013205	AAC	2	6	379533	379538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_013205	GTT	2	6	379564	379569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_013205	GAT	2	6	379630	379635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_013205	GAC	2	6	379727	379732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_013205	GAA	2	6	461092	461097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_013205	CAG	2	6	461202	461207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_013205	CTTGA	2	10	461329	461338	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1410	NC_013205	GGA	2	6	461393	461398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_013205	GGA	2	6	463022	463027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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